Ущелье Иссык-Ата известно еще со времен древних письменных источников. Здесь находятся знаменитые иссык-атинские горячие сероводородные источники, древнее изображение Будды и множество других достопримечательностей. В 12-14 веках ущелье стало колыбелью буддизма в регионе, и поэтому Иссык-Ата сегодня является не только уникальным природным памятником, но и местом с удивительной историей.
Курорт в Иссык-Ате является старейшим курортом Чуйской долины и функционирует с 1895 года. Это место известно своей геотермальной активностью с древних времен и в советское время стало одним из самых известных курортов Кыргызстана. Сероводородная вода является отличным средством для лечения широкого спектра заболеваний опорно-двигательного аппарата, желудочно-кишечного тракта и многих других. На территории курорта есть плавательные бассейны с горячей минеральной водой, которые открыты круглый год. Посещение бассейнов является платным, и цены начинаются от 100 сомов с человека.
В ущелье также много природных достопримечательностей. В нижней части ущелья находится интересное ответвление — Иссык-Атинский Туюк, о котором имеется отдельная статья. Всего в 1,5 километрах от курорта расположен десятиметровый водопад Мраморный, который является одним из самых популярных мест в Иссык-Ате. Также в ущелье находятся водопады Бала-Партак и Джары-Таш. Примечательной является неприступная гора Ботвей (Бытый), у подножия которой ущелье разделяется на две части — Бытый и Аяк-Кель.
В Иссык-Ате также много озер. В правой части ущелья, известной как Аяк-Кель, последовательно расположены три небольших озера, среди которых самое большое — Орто-Кель.